Autasasinofilia tiene de protagonista a un profesor de instituto llamado Haruto Higashiyama, quien tiene una afición que le cuesta mucho desarrollar. Y es que desea ser asesinado por una estudiante de instituto. Pero no de cualquier manera, no vale cualquier estudiante. Debe de ser una chica mona y delicada quien le quite su vida y con sus propias manos. Al ser esta una afición tan peculiar, el pobre Haruto no puede compartirla con nadie y se la guarda para sí mismo.

En el instituto donde trabaja, Maho Sasaki capta su atención, una chica de 16 años que podría ser la candidata perfecta para cumplir su filia. Para ello, debe de planificar un plan perfecto, ya que solo tendrá una oportunidad de ver cumplido su sueño.

Aparte de Haruto y Maho, encontramos con una serie de personajes secundarios en los que se profundiza bastante y que a la vez enriquecen mucho la obra, ya que tienen cierta carga de protagonismo en el desarrollo de la historia. Entre ellos encontramos a Aoi Goto, amiga de Maho con síndrome de Asperger; Yukio Kawahara, un compañero de clase que está prendado de Maho; y Satsuki Fukagawa, una psicóloga clínica que se incorpora a trabajar en el instituto.

Con este plantel de personajes sobre el tablero, se desarrolla una interesantísima historia llena de estratagemas, intereses personales y oscuros pasados. Para ello, se observan diferentes flashbacks que nos permiten conocer más aún la psique de los personajes.